在东莞地区，有多家医院在治疗金黄色葡萄球菌性边缘性角膜炎方面具有良好的口碑和专业水平。以下是一些推荐的医院：

东莞市人民医院

• 医院等级：三甲综合医院
• 专家推荐：张颖栩主任医师，擅长对各种眼科常见病、疑难病症的诊治，尤其在眼外伤、白内障及玻璃体视网膜疾病等领域有较深造诣。
• 医院简介：东莞市人民医院始建于1888年，是我国最早建立的西医院之一，现已发展成为集医疗、教学、科研及预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院。

东莞市松山湖中心医院

• 医院等级：三甲综合医院
• 专家推荐：陈硕主任医师，擅长白内障超声乳化吸除联合人工晶体植入术、小切口白内障手术、青光眼手术及早产儿眼底病变筛查。
• 医院简介：广东医科大学附属东莞松山湖中心医院具有百年光荣历史，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健于一体的市属综合性三级甲等公立医院。

东莞虎门爱尔眼科医院

• 医院等级：三级眼科专科医院
• 特色项目：葡萄膜炎、视网膜病变、黄斑裂孔、黄斑前膜等。
• 医院简介：东莞虎门爱尔眼科医院坐落于广东省东莞市虎门镇，提供近视、白内障、青光眼、眼底病等多种专业眼科医疗服务。

东莞华厦眼科医院

• 医院等级：三级眼科专科医院
• 特色项目：眼底病、眼外伤、葡萄膜炎等。
• 医院简介：东莞华厦眼科医院是一所现代化的眼科专科医院，致力于医疗、教学、科研、防盲和公益等多项服务。

以上医院在治疗金黄色葡萄球菌性边缘性角膜炎方面都有丰富的经验和专业的医生，您可以根据自己的实际情况和需求选择合适的医院进行就诊。建议在选择医院前，可以通过医院的官方网站或电话咨询了解更多信息。