山东农村合作医疗的报销比例如下：
- 在各乡镇定点医疗机构住院的农民 ：
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住院费用在100元（含100元）以下的部分不予补助。
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100元以上—1000元补助40%。
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1000元以上—3000元补助50%。
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3000元以上部分补助60%。
- 在县级定点医疗机构住院的农民 ：
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住院费用在500元以下的部分不予补助。
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500元以上—2000元补助30%。
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2000元以上—5000元补助40%。
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5000元以上部分补助50%。
- 在县外县以上定点医疗机构住院的农民 ：
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住院费用在800元以下的部分不予补助。
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800元以上—2000元补助20%。
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2000元以上—5000元补助30%。
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5000元以上部分补助40%。
- 门诊补偿 ：
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村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。
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镇卫生院就诊报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。
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二级医院就诊报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
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三级医院就诊报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
- 特殊人群和情况 ：
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60周岁以上老人在镇卫生院住院，治疗费和护理费每天补偿10元，限额200元。
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自身原因导致的意外伤害，除《山东省新型农村合作医疗诊疗项目目录》规定不予报销的情形项目外，统一住院报销起付线1000元，报销比例执行分段原则，16周岁至60周岁之间的报销比例20%，低于16周岁或高于60周岁的报销比例30%。
这些报销比例和限额可能会根据政策调整有所变化，建议在实际操作中参考最新的政策文件。