疫苗接种记录消失可能有以下几种原因：
- 外省预防接种记录不能自动同步 ：
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不同省份使用不同的预防接种信息系统，这些系统在数据格式、录入标准、更新频率等方面存在差异，不能实时实现各省的数据交换。
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各省数据需要上传到国家平台进行共享，各省预防接种信息系统才能调取相关接种记录。
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如果在外省接种疫苗，建议回莞后到就近的预防接种门诊由工作人员手工同步外省的接种记录，或工作人员根据受种者的接种凭证，手工补录接种记录。
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预防接种系统里必须录入了受种者的身份证号码，才能实现跨省调动预防接种档案。因此，如预防接种工作人员向受种者询问身份证号码录入预防接种系统，请受种者给予配合。
- 出现重复档案 ：
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受种者在不同门诊接种过疫苗，有可能出现重复档案。
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出现重复档案后，受种者有可能会发现原“粤苗APP”绑定的档案不见了。
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这种情况需要受种者到预防接种门诊提供接种记录进行核实后，门诊工作人员整合预防接种电子档案，受种者就能通过“粤苗APP”查询到完整的预防接种记录。
- 健康码不显示新冠疫苗接种信息 ：
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个人健康码信息是否完善有关，而不是接种单位未给你及时上传。
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如果之前健康码有显示新冠疫苗的接种信息，但突然不见了的话，有可能是因为个人的新冠接种个案与曾经接种的个案有重复，而经过数据合并查重之后，就会将一方的接种个案信息覆盖。
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此时可以联系接种单位进行核实恢复。
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另外，也有可能是信号不好造成的，接种疫苗的信息显示是需要网络信号的，如果当时手机信号不好的话，也会显示不出来，一般需要重启刷新。
- 系统更新延迟 ：
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虽然新冠疫苗接种数据统计是全国联网的，但完全更新普及需要一定时间，所以通常会有延迟。
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这种情况下就有可能在网上查不到接种记录，建议先等待一段时间再进行查询。
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如果实在是急需接种证明，建议可以到接种单位开具接种证明。
- 录入信息延迟或错误 ：
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接种疫苗后，信息录入和上传可能需要时间，有时会出现延迟或错误。
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如果查不到疫苗接种信息，最好的方式就是联系疾控中心，他们能在第一时间联系集中疫苗的医院，然后核对接种人信息，这样就能在新冠疫苗健康码及时显示接种疫苗信息。
综上所述，疫苗接种记录消失可能是由于系统同步问题、重复档案、健康码信息不完善、系统更新延迟或录入信息错误等原因。建议受种者根据具体情况，联系相关预防接种门诊或疾控中心进行核实和恢复。