在广州治疗基质性角膜炎，中山大学中山眼科中心、暨南大学附属第一医院和广州天河区中医院是综合实力较强的选择，其中中山眼科中心以顶尖专家团队和角膜病专科优势尤为突出，而天河区中医院则以二甲医院中的高性价比诊疗服务见长。
中山大学中山眼科中心：作为全国顶尖眼科专科医院，拥有王智崇、陈家祺等资深角膜病专家，擅长复杂角膜移植手术和眼表重建技术，尤其对化学伤角膜移植和干眼症综合治疗经验丰富。
暨南大学附属第一医院：综合性三甲医院，眼科为广东省特色重点学科，设备先进，擅长白内障联合角膜病治疗，微创技术处于省内领先水平。
广州天河区中医院：二甲医院中口碑优异，眼科设施齐全，中医特色疗法结合现代技术，对轻中度基质性角膜炎的保守治疗更具性价比。
其他推荐：广州医科大学附属第二医院、何贤纪念医院（番禺区妇幼保健院）分别以专家号源充足和妇幼群体眼病综合管理为特色，适合不同需求患者。
建议根据病情严重程度和就诊便利性选择医院，复杂病例优先考虑专科强院，常规治疗可参考性价比和就近原则。