合作医疗跨乡镇通常可以报销，但具体政策和报销比例可能因地区而异，以下是一般情况：
门诊报销
一般情况下：合作医疗的门诊报销通常限定在参保地的定点医疗机构，跨乡镇的门诊就医可能无法直接报销。例如，在A乡镇参保的合作医疗，去B乡镇的门诊就医，可能无法享受门诊报销待遇。
特殊情况：部分地区对慢性病、特殊疾病等门诊费用有特殊报销政策，可能允许跨乡镇报销，但需要办理相关手续，如慢性病认定等。
住院报销
一般情况下：合作医疗的住院报销范围较广，跨乡镇住院治疗通常可以报销。例如，在A乡镇参保的合作医疗，去B乡镇的定点医疗机构住院，只要符合报销范围和政策，就可以享受住院报销待遇。
异地就医备案：如果需要跨统筹地区住院治疗，通常需要办理异地就医备案手续。备案后，在就医地的定点医疗机构住院，可以按照参保地的报销政策进行报销。例如，安徽省芜湖市的参保人员办理异地就医备案后，在就医地的异地联网定点医药机构可以享受住院及5种门诊慢特病跨省直接结算服务。
报销所需材料和流程
所需材料：住院报销一般需要提供住院发票、合作医疗证历本（或病历）、费用明细清单、出院小结、身份证等材料。
报销流程：参保人员将报销所需资料备齐后交至村（社区），由村（社区）合作医疗联络员审核后报镇合作医疗联络员，再由镇联络员送区农易办结报中心进行报销。
建议您在就医前咨询当地的医保部门或合作医疗经办机构，了解具体的报销政策和流程。