广西医科第一附属医院设有多个临床科室和医技科室，具体包括：

1. 临床科室 ：

• 呼吸与危重症医学科

• 消化内科

• 心血管内科

• 内分泌科

• 肾内科

• 血液内科

• 神经内科

• 肿瘤内科

• 风湿免疫科

• 肝胆外科

• 血管外科

• 神经外科

• 胃肠腺体外科

• 胸外科

• 创伤骨科

• 手外科

• 脊柱骨病外科

• 骨关节外科

• 泌尿外科

• 结直肠肛门外科

• 小儿外科

• 器官移植科

• 烧伤整形外科

• 整形美容外科

• 妇科

• 产科

• 广西生殖医学研究中心产前诊断与遗传病诊断科

• 儿科一病区、儿科二病区、儿科三病区（地方病科）

• 新生儿科

• 儿童重症监护病房

• 广西地中海贫血重点实验室

• 眼科

• 耳鼻咽喉头颈外科

• 口腔科

• 老年病学心血管内科、老年病学呼吸内科、老年病学神经内科、老年病学综合内科、老年病学内分泌代谢科、老年病学消

2. 医技科室 ：

• 麻醉手术中心

• 男性学科

• 中医科

• 感染性疾病科

• 皮肤科

• 核医学科

• 康复医学科

• 放疗科

• 心理卫生科

• 临床营养科

• 输血科

• 药学部

• 门诊办公室

• 检验科

• 影像科

• 病理科

• 内镜中心

• 超声医学科

• 高压氧科

• 消毒供应中心

• 药房

• 病案统计科

• 信息科

• 护理部

这些科室涵盖了内科、外科、妇产科、儿科、眼科、耳鼻咽喉头颈外科、口腔科、老年病科、肿瘤科等多个领域，并且有多个科室是国家临床重点专科和广西省级重点学科。