目前并没有官方统一的湖北黄冈治疗Wegner肉芽肿伴发葡萄膜炎的医院排名。不过，你可以参考以下几类医院来选择合适的医疗机构：

综合实力强的三甲医院

• 黄冈市中心医院：作为当地规模较大、综合实力较强的三甲医院，其眼科具备一定的诊疗水平和经验。医院拥有先进的检查设备和专业的医疗团队，能够对Wegner肉芽肿伴发的葡萄膜炎进行较为全面的诊断和治疗。可以开展眼部常规检查、免疫相关指标检测等项目，为疾病的治疗提供依据。
• 黄冈市中医医院：该医院在中西医结合治疗方面有一定特色。对于Wegner肉芽肿伴发的葡萄膜炎，除了运用西医的常规治疗方法外，还能结合中医的辨证论治，采用中药内服、外用以及针灸等疗法，可能在缓解症状、调节机体免疫功能等方面起到一定的辅助作用。

眼科专科医院（如有）

如果当地有眼科专科医院，虽然可能规模不如综合医院大，但在眼科疾病的诊疗上往往更加专业和精细。专科医院的医生可能在眼部疾病的诊断和治疗方面有更深入的研究和丰富的临床经验，对于Wegner肉芽肿伴发的葡萄膜炎这类复杂的眼部疾病，能够提供更专业的医疗服务。

在选择医院时，除了考虑医院的排名和名气外，还可以关注医生的专业背景、临床经验以及患者的评价等因素。由于Wegner肉芽肿是一种全身性疾病，治疗可能需要多学科协作，因此选择能够进行多学科会诊的医院可能更有利于患者的治疗。