北京大学第一医院中心院区和大兴院区存在多方面的区别，以下是具体情况：
地理位置及交通便利性
中心院区 ：位于北京市西城区复兴门内大街 115 号，地处北京市中心区域，交通便利，周边有多条公交线路和地铁线路经过，方便患者前来就诊。
大兴院区 ：位于北京市大兴区乐园路 5 号、7 号，毗邻五环主路，靠近 4 号线地铁 “高米店南站”，向北 500 米处，紧邻体育中心、公园绿地、商业中心等公共场所，交通也较为便利，且院内设置地下停车位 1167 个，未来还将增加地上停车位。
科室设置及医疗资源
中心院区 ：作为历史悠久的综合性医院，科室设置齐全，涵盖了几乎所有的临床科室和医技科室，能够为患者提供全面的医疗服务。在多个领域拥有丰富的医疗资源和专家团队，尤其在一些传统优势学科上具有深厚的积淀和较高的声誉。
大兴院区 ：以 “大专科、小综合” 为学科建设基本理念，重点发展妇女儿童医学中心、肿瘤治疗中心、内镜诊疗中心、急危重症救治中心、介入治疗中心等五大特色医学中心。也在逐步完善其他综合科室的建设，但相对中心院区而言，科室设置更为聚焦和专业化。
就诊流程及服务模式
中心院区 ：由于患者流量较大，就诊流程相对较为复杂，患者可能需要在不同的科室和楼层之间穿梭，排队等候时间也可能较长。不过，医院也在不断优化就诊流程，提高医疗服务效率。
大兴院区 ：注重优化就诊流程，提供人性化、个性化的医疗服务。例如，在门诊区域设置 “入院准备中心”，将入院预约登记、住院手续办理、床位统筹调配等业务进行全面整合，实现患者入院 “一站式” 服务。还实行了 “全院一张床” 的床位动态管理模式，对全院床位资源进行集约化、智能化动态管理，提高了床位使用效率，减少了患者的等待时间。
医院规模及设施
中心院区 ：医院规模相对较小，建筑面积有限，但设施齐全，能够满足日常的医疗需求。由于空间限制，可能在患者就医体验和舒适度方面有一定的局限性。
大兴院区 ：占地面积 21.6 万平方米，建筑面积更大，规划更为现代化，设施更为先进。院区内建有门诊楼、医技楼、急诊楼、住院楼、科研楼、行政教学楼等，为患者提供了更加宽敞、舒适、便捷的就医环境。
医疗服务对象及辐射范围
中心院区 ：主要服务于北京市中心区域及周边地区的患者，由于其在医疗领域的知名度和影响力，也吸引了全国各地的患者前来就诊。
大兴院区 ：重点服务于大兴区及首都南部地区的患者，同时也为周边地区的患者提供医疗服务，有助于缓解城南百姓的就医难题，促进首都医疗事业的均衡发展。