湖北荆门治疗棘阿米巴性角膜炎比较好的医院推荐：荆门市第一人民医院。

推荐理由

1. 医院等级：荆门市第一人民医院是三级甲等综合医院，医疗水平和设备先进。
2. 科室设置：医院设有眼科，能够提供专业的角膜炎治疗。
3. 医生团队：医院拥有多位眼科专家，如王少杰主任医师、余琦主任医师等，他们在眼底病、斜弱视及眼眶肿瘤、泪道疾病等疾病的诊断及治疗方面有丰富的经验。
4. 手术能力：医院成功开展了穿透性角膜移植术等显微手术，能够为棘阿米巴性角膜炎患者提供手术治疗。

其他推荐医院

1. 钟祥市人民医院：也是三级甲等综合医院，设有眼科，能够提供专业的角膜炎治疗。
2. 荆门市第二人民医院：三级甲等综合医院，设有眼科，能够提供专业的角膜炎治疗。

这些医院在荆门市都有一定的口碑和医疗实力，患者可以根据自己的实际情况选择合适的医院进行治疗。

治疗方法

1. 药物治疗：使用抗阿米巴药物，如氯己定滴眼液、普罗帕脒滴眼液等，抑制病原体生长。
2. 病灶清创术：通过手术清除角膜表面的病灶组织，减少病原体数量。
3. 角膜上皮刮除术：适用于角膜上皮有阿米巴包囊的情况，去除包囊减少感染源。
4. 角膜移植术：对于药物治疗和其他手术治疗无效的患者，可以考虑角膜移植术。

患者在治疗过程中应遵循医嘱，按时用药，定期复查，以达到最佳的治疗效果。