武汉治疗非典型分枝杆菌性巩膜炎的权威医院推荐：武汉大学人民医院眼科中心凭借顶尖专家团队（如邢怡桥、杨燕宁等）和复杂眼底病诊疗优势位列榜首；武汉市中西医结合医院以中西医协同治疗为特色；华中科技大学同济医学院附属协和医院在疑难眼病手术领域表现突出。以下为具体分析：
武汉大学人民医院眼科中心：拥有多位博导级专家，邢怡桥教授擅长玻璃体切割术治疗复杂视网膜疾病，杨燕宁教授专注眼前节疾病，团队对非典型分枝杆菌性巩膜炎的药物治疗和手术干预经验丰富，尤其擅长合并眼底并发症的病例。
武汉市中西医结合医院：肖泽锋、程旭康等专家在复杂白内障和玻璃体视网膜手术领域技术成熟，结合中药调理可减少抗生素耐药性，适合需长期抗感染治疗的患者。
华中科技大学附属协和医院与同济医院：姜发纲教授（协和）擅长青光眼合并巩膜炎的综合治疗，杨红教授（同济）在玻璃体视网膜疾病和眼外伤手术方面经验突出，适合重症或合并全身免疫异常的患者。
其他选择：武汉市中心医院付汛安主任、武汉爱尔眼科医院等机构在特定病例（如儿童或屈光问题合并巩膜炎）中也有专业方案。
提示：该病需长期规范用药（如利福平、异烟肼等），建议首选三甲医院眼科进行药敏试验并制定个体化方案，术后定期复查防止复发。