全国治疗呼吸道疾病较好的三甲医院包括以下几家：
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中国中医科学院西苑医院 ：创建于1955年，是新中国成立后第一所大型中医医院，具有中医特色，诊疗优势明显，集医疗、科研、教学、保健为一体的三级甲等综合性中医医院。
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天津市胸科医院 ：以治疗心肺疾病为主，集医、教、研、防为一体的现代化三级甲等专科医院，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
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304医院 ：中国人民解放军总医院第四医学中心，前身为中国人民解放军第三O四医院，2004年并入解放军总医院，对内称解放军总医院第三〇四临床部，对外称解放军总医院第一附属医院。
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南昌市中西医结合医院-附院 ：江西省中西医结合医院，是集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的国家首批三级甲等中西医结合医院。
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山东省胸科医院 ：隶属于山东省卫生健康委员会，始建于1949年，逐渐发展为集医疗、教学、科研、预防、保健功能为一体的新型专科医院。
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重庆市第九人民医院 ：在治疗呼吸道疾病方面具有较好的口碑和医疗设施。
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秦皇岛市中医院 ：在治疗呼吸道疾病方面有着丰富的经验。
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广元市中医院 ：在治疗呼吸道疾病方面也有较好的口碑。
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天津市安定医院 ：天津市卫生局直属的三级精神卫生专科医院，对精神分裂症、心境障碍等精神疾病有丰富的诊断治疗经验。
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广东省中医院大学城医院 ：广东省中医院分院，位于广州市番禺区，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
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海南省中医院 ：在治疗呼吸道疾病方面也有较好的口碑。
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北京永安中医医院 ：在治疗呼吸道疾病方面有着丰富的经验。
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张掖市人民医院 ：集医疗、预防、保健、急救、康复、科研、教学为一体的“三级甲等”医院。
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北京燕竹医院哮喘治疗中心 ：全国地区规模最大、最专业的哮喘病诊疗基地。
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井冈山大学附属医院 ：集医疗、急救、教学、科研、预防保健、康复等功能为一体的三级甲等综合性省直医院。
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曲靖市第二人民医院 ：在治疗呼吸道疾病方面有一定的经验。
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南华大学附属第三医院 ：在治疗呼吸道疾病方面也有较好的口碑。
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重庆三一八医院呼吸科 ：专注呼吸系统诊疗，对哮喘、慢阻肺等肺部疾病有独特的诊疗手段。
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重庆医科大学附属第一医院 ：呼吸与危重症医学科是国家重点科室，在呼吸系统疾病的诊断和治疗方面处于国内领先水平。
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陆军军医大学第二附属医院 ：在治疗呼吸道疾病方面也有较好的口碑。
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广州医科大学附属第一医院 ：呼吸内科历史悠久，培养了大量医学人才。
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中日友好医院 ：王辰院士领衔的团队在呼吸系统疾病治疗方面具有较高水平。
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四川大学华西医院 ：呼吸科历史悠久，诊疗水平国内领先。
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北京协和医院 ：呼吸科专家团队强大，诊疗水平高。
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瑞金医院 ：呼吸科历史悠久，诊疗水平高。
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复旦大学附属中山医院 ：呼吸科由呼吸科泰斗吴绍青教授创建，历史悠久。
这些医院在治疗呼吸道疾病方面都有较高的专业水平和丰富的临床经验，建议根据具体病情和地理位置选择合适的医院进行就诊。