西安交通大学第二附属医院（简称交大二附院）的强项包括以下几个方面：
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皮肤科 ：交大二附院的皮肤科是国家教育部医学重点学科，也是国家卫计委评为的国家临床重点专科建设单位。
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泌尿外科 ：泌尿外科同样是国家教育部医学重点学科和国家临床重点专科建设单位。
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神经内科 ：神经内科入选了2023年国家临床重点专科建设项目。
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康复医学科 ：康复医学科也入选了2023年国家临床重点专科建设项目。
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骨科 ：骨科是陕西省医学重点学科，也是国家临床重点专科建设单位。
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消化内科 ：消化内科是国家临床重点专科建设单位，同时也是陕西省医学重点学科和优势医疗专科。
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麻醉科 ：麻醉科是国家临床重点专科建设单位。
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小儿外科 ：小儿外科是国家临床重点专科建设项目。
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肿瘤病院 ：肿瘤病院是国家临床重点专科建设项目。
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心血管病院 ：心血管病院是国家临床重点专科建设项目。
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妇科 ：妇科是博士学位和硕士学位授予点，陕西省医学会妇产科分会主委单位，国家首批四级妇科内镜手术培训基地，陕西省妇科疾病诊疗中心，陕西省产科临床重点专科，国家妇产疾病（协和）临床医学研究中心分中心，国家住院医师规范化培训基地以及手术机器人中国妇科临床手术教学示范基地。
这些强项科室在医疗、教学、科研等方面均具有显著优势，并在西北及陕西省医学界中具有重要影响和学术地位。