全国治疗疑难杂症最好的医院主要包括以下几家：
- 北京协和医院 ：
-
综合实力 ：北京协和医院在复旦版《2023年度中国医院专科声誉排行榜》中，病理科、放射科、风湿科、妇产科、普通外科、神经内科、核医学科、急诊医学科、重症医学科、变态反应科、罕见病医学科等11个学科位居全国首位，共28个学科列入全国前十位，综合实力雄厚。
-
专科特色 ：作为国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，北京协和医院多科协作发挥综合优势，拥有38个专家会诊团队，最大限度地整合多学科资源，开展跨学科协作诊疗活动。
- 四川大学华西医院 ：
- 综合实力 ：华西医院是中国西部疑难危急重症诊疗的国家级中心，也是世界规模第一的综合性单点医院，拥有中国规模最大、最早整体通过美国病理家学会（CAP）检查认可的医学检验中心。
- 中国人民解放军总医院（301医院） ：
- 综合实力 ：301医院医生水平非常高，挂号人超级多，全国人民的疑难杂症都会跑到医院去看。
- 上海交通大学医学院附属瑞金医院 ：
- 综合实力 ：在复旦版《2023年度中国医院专科声誉排行榜》中，瑞金医院排名第四，显示出其强大的综合实力。
- 复旦大学附属中山医院 ：
- 综合实力 ：在复旦版《2023年度中国医院专科声誉排行榜》中，中山医院排名第五，同样显示出其强大的综合实力。
- 中山大学附属第一医院 ：
- 综合实力 ：在复旦版《2023年度中国医院专科声誉排行榜》中，中山医院排名第六，综合实力稳定。
- 华中科技大学同济医学院附属同济医院 ：
- 综合实力 ：在复旦版《2023年度中国医院专科声誉排行榜》中，同济医院排名第七，去年排名第八，上升一个名次。
- 空军军医大学西京医院 ：
- 综合实力 ：在复旦版《2023年度中国医院专科声誉排行榜》中，西京医院排名第八，去年排名第七。
这些医院在各自的专业领域内具有强大的实力和丰富的经验，能够为患者提供高水平的诊疗和优质服务。建议患者根据具体病情选择合适的医院进行咨询和治疗。