中日友好医院和北医三院都是北京知名的大型三甲医院，各有其特色和优势。以下是一些比较：
- 儿科 ：
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北京儿童医院 、 儿研所 和 北大妇产儿童医院 在儿科方面表现较好，尤其是儿童专科医院，其专业性和经验更为丰富。
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北医三院和协和医院的大型三甲医院儿科也不错，能够满足大部分儿科需求。
- 产科服务 ：
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中日友好医院 ：有中医特色，产科服务包括无痛分娩和导乐服务，但导乐服务反馈一般。
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北医三院 ：产科服务较为全面，无痛分娩技术成熟，有专门的麻醉师操作，且支持家属全程陪护，但周末可能没有麻醉师。
- 病房环境 ：
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中日友好医院 ：普通部病房环境干净整洁，有6人间和母婴同室选项，但整体环境相对较小，高端病房（如国际部）条件较好，但费用较高。
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北医三院 ：产科病房多为三人间带卫生间，也有六人间，整体环境较为宽敞，但病房分配随机，不能选择。
- 陪护和护工服务 ：
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中日友好医院 ：普通部允许一人陪护，女性家属和护工二选一，护工服务较为便宜。
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北医三院 ：允许一名家属陪护，需要租赁行军床，护工服务费用较高，但家属可以全程陪产。
- 其他服务 ：
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中日友好医院 ：整形外科较为有名，技术多样，审美观念新颖。
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北医三院 ：整形外科历史悠久，技术成熟，能够处理复杂和高难度的整形手术。
建议
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如果主要关注儿科服务，建议选择北京儿童医院、儿研所或北大妇产儿童医院 。
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如果关注产科服务，尤其是无痛分娩和家属陪护，北医三院可能更为合适 。
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如果对整形外科有需求，中日友好医院和北医三院都有较为专业的整形外科，可以根据具体需求和医生技术进行选择 。
综合考虑，两家医院各有优势，具体选择哪家医院还需根据个人实际需求和偏好来决定。