根据最新的信息，以下是部分男科医院三甲医院的排名情况：
- 中国人民解放军总医院泌尿外科
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复旦排名 ：全国泌尿外科第1名
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上榜理由 ：综合实力强大，医疗资源先进，诊疗设备齐全，尤其在结石、肾脏、膀胱、前列腺、肾上腺等方面具有显著优势。
- 北京大学第一医院男科中心
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复旦排名 ：全国男科中心第2名
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上榜理由 ：拥有强大的医疗团队和先进的诊疗设备，涵盖从婴幼儿到成年男性的各种问题。
- 上海交通大学医学院附属仁济医院男科
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复旦排名 ：全国男科中心第7名
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上榜理由 ：卫生部的重点专科，擅长无精子症规范化诊疗、勃起功能障碍和早泄治疗。
- 广州第一直属医院男科
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广州三甲医院男科排行 ：第1名
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上榜理由 ：拥有众多知名三甲医院专家坐诊，包皮技术处于前沿。
- 江苏省人民医院泌尿外科
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复旦排名 ：江苏省泌尿外科诊疗中心
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上榜理由 ：集医疗、教学、科研于一体，学科规模、专科设备、技术水平国内一流。
- 南京鼓楼医院男科中心
- 上榜理由 ：历史悠久、实力雄厚，擅长前列腺疾病、性功能障碍、男性不育等。
- 南京市第一医院男科中心
- 上榜理由 ：南京市重点学科，拥有强大的专家队伍和先进的诊疗设备。
- 南京军区南京总医院男科中心
- 上榜理由 ：军队重点学科，技术精湛，服务周到。
- 北京大学人民医院泌尿外科
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复旦排名 ：全国泌尿外科第10名
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上榜理由 ：在泌尿外科领域具有显著的医疗水平和科研实力。
- 上海交通大学医学院附属瑞金医院泌尿外科
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复旦排名 ：全国泌尿外科第11名
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上榜理由 ：综合实力强，尤其在肾脏疾病和泌尿系统肿瘤方面具有优势。
这些医院在男科领域具有显著的医疗水平和科研实力，建议根据具体需求和地理位置选择合适的医院进行就诊。