头痛在临床上可分为原发性头痛和继发性头痛两类。

原发性头痛指不能归因于某一确切病因，不是由器质性病变引起的头痛，常见的类型有偏头疼、紧张性头疼、丛集性头痛，丛集性头痛在临床上属于三叉自主性的头疼。

继发性头痛往往是由于某种疾病引起的疼痛。临床上常见的包括第一是头颈部的创伤，创伤以后可以造成头痛。第二是头颈部血管性疾病，比如脑血管病包括脑梗死、脑出血、蛛网膜下腔出血，蛛网膜下腔出血可以造成剧烈的疼痛。还有急性硬膜下血肿、颅内血管畸形、血管炎等疾病，血管炎可以表现为颞部波动性的疼痛，还有动脉夹层、脑静脉血栓形成等。第三是头颈部一些非血管性疾病，比如颅内压增高、自发性的低颅压、颅内的占位如脑部的肿瘤、颅底凹陷症等都可以引起疼痛。第四是应用某些物质或者某些物质戒断停药以后造成的疼痛，比如治疗心脏病的硝酸酯类的药物引起的疼痛，酒精引起的疼痛，味精引起偏头痛的发作。还有一部分止痛药物过度的使用可以引起药物过度使用性头痛，咖啡因、阿片类可以引起一些戒断性的头疼。第五是颅内感染，如脑膜炎像结核性脑膜炎、隐球菌性脑膜炎还有布氏杆菌病，都可以引起疼痛。第六是内环境紊乱引起的疼痛，比如高海拔、潜水、乘飞机旅行时甚至高血压脑病的时候，都可以引起疼痛；还有心脏病也可以引起头痛，甚至引起剧烈的疼痛而心脏症状不明显；进食方面漏吃一顿饭也可以引起疼痛。第七是头颈部的疾病，还有眼科、耳鼻喉科、副鼻窦以及口腔科的疾病，都可以引起在相应区域的疼痛。第八是精神障碍引起的疼痛，比如焦虑、抑郁本身可以引起疼痛，另外还有一些精神障碍也可以引起头痛。第九还有一些其他的像三叉神经痛、舌咽神经痛等也可以引起疼痛。