云南玉溪社保基数12900元时，公积金缴纳金额计算如下：

1. 公积金缴存比例：

   • 单位和职工的住房公积金缴存比例均不得低于职工上一年度月平均工资的5%，不得高于12%。
   • 缴存单位可在5%-12%区间内自主确定缴存比例。

2. 公积金缴存基数：

   • 住房公积金缴存基数应按照职工本人上一年度月平均工资确定。
   • 最高不超过市相关部门公布的云南玉溪2023年在岗职工月平均工资的3倍（27267元），最低不低于云南玉溪职工最低工资标准（目前执行标准为1840元）。

3. 公积金缴纳金额计算：

   • 职工个人公积金缴纳金额 = 缴存基数 × 个人缴存比例
   • 单位公积金缴纳金额 = 缴存基数 × 单位缴存比例

假设单位和职工的缴存比例均为10%（在5%-12%区间内），则：

• 职工个人公积金缴纳金额 = 12900元 × 10% = 1290元
• 单位公积金缴纳金额 = 12900元 × 10% = 1290元

当社保基数为12900元时，个人和单位分别需要缴纳的公积金金额为1290元。

总结：

• 公积金缴纳比例可在5%-12%区间内自主确定。
• 公积金缴存基数最高为27267元，最低为1840元。
• 具体缴纳金额根据确定的缴存比例计算得出。