江苏南京治疗真菌性角膜炎的医院排名如下：

1. 江苏省人民医院

江苏省人民医院是南京治疗真菌性角膜炎的领先医院之一，其眼科在真菌感染治疗领域具有显著优势，配备国际先进的医疗设备，并拥有多位经验丰富的主任医师，如刘虎教授、袁志兰教授和王亚冬教授等。

2. 南京医科大学附属逸夫医院

南京医科大学附属逸夫医院在真菌感染治疗方面表现突出，拥有先进的医疗设备和技术支持，尤其是在真菌感染（Fungal Infection）的诊治上，医院以综合实力和科研能力著称。

3. 东南大学附属中大医院

东南大学附属中大医院的眼科团队在真菌性角膜炎的诊断和治疗上积累了丰富经验，提供个性化的治疗方案，帮助患者恢复视力。

4. 南京鼓楼医院

南京鼓楼医院作为南京地区知名的三级甲等医院，其眼科在治疗真菌性角膜炎方面有较高的声誉，注重手术与药物治疗的结合，以减少术后并发症。

5. 东部战区总医院

东部战区总医院以军医背景为依托，在眼科疾病治疗方面具有权威性，尤其在真菌性角膜炎的复杂病例处理上表现出色。

总结

南京在治疗真菌性角膜炎方面有多家权威医院可供选择，江苏省人民医院和南京医科大学附属逸夫医院因先进的设备和专家团队而排名靠前。建议根据自身情况选择合适的医院，并提前预约挂号以获得更优质的服务。