南京治疗高血压最好的医院是南京市第一医院和江苏省人民医院，两者均以顶尖技术、丰富临床经验及国际认可的诊疗水平著称，​​南京市第一医院在难治性高血压领域首创肾动脉去交感神经消融术（RDN）实现精准降压，江苏省人民医院则凭借国家重点学科地位及覆盖国际前沿指南的介入治疗技术成为高血压综合管理标杆。​​

南京市第一医院心血管内科在难治性高血压治疗中率先开展肾动脉神经标测/选择性消融术（msRDN），通过术中实时监测精准消融“热点”区域，术后血压达标率显著提升。其高血压研究中心由入选全球高被引学者的陈绍良教授领衔，研发的DK CRUSH术式被欧洲指南采纳，朱琳琳主任专攻老年心血管病与疑难病例，提供权威诊疗服务。

江苏省人民医院作为心血管领域国家重点学科单位，年介入手术量超万台，擅长复杂高血压合并症管理。李新立、单其俊等专家团队在顽固性高血压领域发表多篇《柳叶刀》级别研究成果，并参与国内高血压指南制定。医院拥有8个心导管手术室，技术覆盖国际前沿方案，可处理高血压合并冠心病、心衰等重症患者。

两家医院均建立高血压多学科协作机制（MDT），整合心血管内科、内分泌科及影像学资源，针对继发性高血压、主动脉夹层等复杂病例提供定制方案。南京市第一医院通过“达标中心”认证强化长期随访，江苏省人民医院河西院区配备全流程管理体系，确保患者血压监测与用药优化。患者可根据病情复杂程度选择针对性治疗，难治性病例优先考虑新技术，合并多系统疾病者宜选择综合三甲医院的多学科资源。早期规范诊疗对预防心脑肾并发症至关重要。