医院科室主任是否是手术最厉害的医生，需结合具体科室和医院管理模式综合判断，结论如下：
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手术能力因科室而异
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在某些科室（如脑外科），所有复杂手术均由主任亲自操刀，其他医生仅作为助手，此时主任的手术能力在科室内处于绝对主导地位。
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在其他科室，主任可能仅负责高难度四级手术，日常手术由主治医生或住院医生完成。例如，三甲医院外科主任通常每天需完成多台四级手术，低级别手术则分配给下级医生。
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行政职责影响手术参与度
- 科主任需兼顾管理、科研和手术任务，部分人因精力有限，可能减少手术操作，转而培养下级医生。例如，有医生因害怕医疗风险或追求职业发展，选择不亲力亲为所有手术。
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职称与临床水平非严格对应
- 主任医师是职称最高级别，但临床水平不一定最强。部分科室高年资主治医生（非主任）因经验丰富，在常见手术和诊疗方面可能更熟练。
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医院管理模式的差异
- 不同医院对科室主任的考核标准不同。例如，以绩效分配为核心的科室可能让主任占据更大比例的手术资源，而注重团队培养的科室则更鼓励下级医生参与手术。
总结 ：科室主任是否手术最厉害需分情况讨论，不能一概而论。高难度手术通常由主任负责，但日常手术可能由主治医生完成；且行政职责、医院管理及个人选择均可能影响实际手术参与度。