云南楚雄社保基数16600元和5000元的主要区别体现在以下方面：
缴费金额
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社保基数为16600元时：
- 个人每月需缴纳的社保费用大约是 1328元 。
- 企业则需承担约 3320元 。
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社保基数为5000元时：
- 个人每月需缴纳的社保费用大约是 412元 。
- 企业则需承担约 1033元 。
缴费比例
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养老保险：
- 基数为16600元时，个人缴纳8%，即 1328元 ；企业缴纳16%，即 2656元 。
- 基数为5000元时，个人缴纳8%，即 400元 ；企业缴纳16%，即 800元 。
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医疗保险：
- 基数为16600元时，个人缴纳2%，即 332元 ；企业缴纳8%，即 1328元 。
- 基数为5000元时，个人缴纳2%，即 100元 ；企业缴纳10%，即 500元 。
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失业保险：
- 基数为16600元时，个人缴纳比例通常在0.2%-0.5%之间，取中间值0.35%，约为 59.5元 ；企业部分约为0.7%，即 357元 。
- 基数为5000元时，个人缴纳比例约为0.35%，即 17.5元 ；企业部分约为0.7%，即 35元 。
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工伤保险与生育保险：
- 这两项由企业全额承担，具体比例依据当地政策而定。假设工伤保险为0.4%，生育保险为1%，合计约为 45元 。
缴费基数上下限
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楚雄市2025年社保缴费基数上下限：
- 下限为全省月平均工资的60%，约合 5280元 ；
- 上限为300%，即 26400元 。
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基数为16600元时，显然高于上限26400元，因此应按照上限进行缴费。
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基数为5000元时，低于上限26400元，但高于下限5280元，因此应按照实际工资进行缴费。
社保基数16600元和5000元在个人和企业需缴纳的社保费用、各险种的缴费比例以及适用的缴费基数上下限等方面均存在显著差异。这些差异直接影响到每月的社保缴费金额和未来的社保待遇。