在云南玉溪，如果社保基数为6900元，个人所得税的扣除将基于调整后的应税所得额，即扣除三险一金后的收入减去个税起征点（5000元）后计算。以下是详细的扣税计算步骤：
社保缴费比例
- 养老保险：单位缴费比例为16%，个人缴费比例为8%。
- 医疗保险：单位缴费比例为8.5%，个人缴费比例为2%。
- 失业保险：单位缴费比例为0.7%，个人缴费比例为0.3%。
- 工伤保险：缴费比例在0.2%-1.9%之间，具体比例根据行业差别费率确定。
扣税计算步骤
- 计算社保个人缴纳部分：
- 养老保险：6900元 × 8% = 552元
- 医疗保险：6900元 × 2% = 138元
- 失业保险：6900元 × 0.3% = 20.7元
社保个人缴纳部分总计：552 + 138 + 20.7 = 710.7元
- 计算应纳税所得额：
应纳税所得额 = 月收入 - 社保个人缴纳部分 - 个税起征点（5000元） = 6900元 - 710.7元 - 5000元 = 1189.3元
- 根据应纳税所得额计算个人所得税：
目前个人所得税税率表，对应的这部分应纳税所得额可能适用于3%的税率（具体税率根据应纳税所得额的不同区间而定）。
个人所得税 = 应纳税所得额 × 税率 = 1189.3元 × 3% = 35.68元
当云南玉溪的社保基数为6900元时，个人需要缴纳的社保费用为710.7元，假设没有其他免税额或专项附加扣除，个人所得税约为35.68元。请注意，以上计算仅供参考，实际扣税金额可能会因个人实际情况和政策变化而有所不同。