在云南曲靖，社保基数13900元和5000元主要存在以下区别：
缴费金额的区别
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养老保险：
- 基数13900元：每月缴费金额为13900元 × 20% = 2780元。
- 基数5000元：每月缴费金额为5000元 × 20% = 1000元。
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医疗保险：
- 基数13900元：每月缴费金额为13900元 × 10% = 1390元。
- 基数5000元：每月缴费金额为5000元 × 10% = 500元。
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失业保险：
- 基数13900元：每月缴费金额为13900元 × 1% = 139元。
- 基数5000元：每月缴费金额为5000元 × 1% = 50元。
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工伤保险和生育保险：
- 这两项保险个人无需缴纳，费用完全由用人单位承担。
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总缴费金额：
- 基数13900元：每月总缴费金额约为2780元（个人） + 3336元（单位） = 6116元。
- 基数5000元：每月总缴费金额约为1000元（个人） + 1200元（单位） = 2200元。
待遇水平的区别
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养老金待遇：
- 基数13900元：由于缴费金额更高，个人账户积累更多，退休后领取的养老金也会更高。
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医疗报销比例和额度：
- 基数13900元：对应的医保报销比例和额度通常会更高。
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失业保险和生育保险待遇：
- 基数13900元：失业金发放标准和生育保险待遇也会相应提高。
个人和单位的负担区别
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个人缴费金额：
- 基数13900元：每月需缴纳2780元 × 8% = 222.4元。
- 基数5000元：每月需缴纳1000元 × 8% = 80元。
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单位缴费金额：
- 基数13900元：每月需缴纳2780元 × 12% = 333.6元。
- 基数5000元：每月需缴纳1000元 × 12% = 120元。
适用人群建议
- 基数13900元：更适合国企职工、事业单位人员或高收入群体，能充分匹配其薪资水平。
- 基数5000元：适用于私营企业普通员工、灵活就业者，或企业为降低用人成本的选择。
总的来说，选择较高的社保基数虽然能带来更好的待遇，但也会增加当前的经济负担。对于收入较高且希望为未来提供更好保障的个人，选择13900元作为缴费基数是明智的。而对于收入较低或当前经济压力较大的个人，选择5000元作为缴费基数可以减轻每月的生活压力。