安徽参保人员在南京住院可以报销，但需办理异地就医备案手续。根据现行医保政策，长三角地区（含安徽、江苏）已实现医保互联互通，符合条件的安徽参保人员在南京定点医院住院可直接结算，报销比例参照参保地标准。关键点在于：①备案后可直接刷卡结算；②未备案需先垫付再回参保地报销；③急诊抢救无需备案。
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备案流程
通过"国家医保服务平台"APP或安徽医保微信公众号提交申请，选择南京的定点医院。备案成功后，在选定的医院住院可直接使用医保卡结算，无需垫付全额医疗费。备案有效期通常为6-12个月，长期驻外人员可申请长期备案。 -
报销标准
执行"参保地政策、就医地目录"原则。即药品和诊疗项目按南京医保目录，起付线、报销比例、封顶线等按安徽当地政策。例如：合肥职工医保在三甲医院报销比例为85%，在南京同等级医院住院同样适用该比例。 -
特殊情况处理
急诊未备案的，可在出院后携带病历、发票等材料回安徽参保地医保窗口手工报销，需在次年3月底前办理。转诊患者需由安徽三级医院开具转诊证明，报销比例比自主备案高5%-10%。 -
重点注意事项
南京部分高端民营医院不在定点范围内，就医前需确认医院资质。生育保险、工伤等特殊情况需提前咨询参保地政策。门诊费用目前仅限部分慢性病可报销，普通门诊仍需自费。
建议安徽参保人员在赴南京前完成备案，并保存好南京医保局服务热线（025-12393）以备咨询。若计划长期在南京工作或居住，可申请医保关系转移接续，享受当地居民同等医保待遇。