​​慢特病申请流程已实现线上线下多渠道覆盖，用户可通过医疗机构直接申请、线上平台自助申报，并享受高效审核与即时结果查询服务，部分病种更支持异地远程鉴定。​​

慢特病申请的具体操作因地区和病种而异，但核心流程通常分为申请、审核及结果反馈三步。参保人需准备身份证、社保卡及二级以上医院出具的病历资料（如诊断证明、检查报告等），通过医院医保窗口或线上平台提交申请。线上申请者可借助“湖北医疗保障”小程序、“安徽医保公共服务”平台等工具，按提示填写信息并上传材料；部分地区如沈阳支持通过“沈阳智慧医保”APP完成申报。

审核阶段以医疗机构或专家鉴定为主，部分城市采用线上专家评审机制，例如郑州的鉴定专家需在2个工作日内完成电子病历评核，确保10个工作日内出具结果。通过后，用户可通过申请平台、医保APP或政务网站实时查询审核状态，部分区域还将同步推送短信通知。需注意，职工与居民医保的覆盖病种存在差异，如长沙职工医保覆盖45个病种而居民医保仅37个，且异地就医需按当地政策操作。

部分病种支持免申请直接结算，例如郑州的恶性肿瘤患者经定点医院确诊后即可享受待遇，而苯丙酮尿症等特定病种需每年重新申请。异地备案人员可关注跨省结算政策，山东等地已开通117个病种的省内互认，省外申报则需通过指定渠道提交材料。建议参保人优先通过线上渠道节省时间，定期核对个人待遇有效期，遇审核不通过时可按要求补充材料或申请复审。