合作医疗报销是否违法需分情况讨论，主要取决于事故责任认定及报销目的是否合规。以下是具体分析：
一、基本原则
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事故责任方承担费用
合作医疗旨在保障参保人员因疾病等非交通事故导致的医疗费用，若事故由第三方责任方（如肇事者）造成，且责任方已确定，医疗费用应由其承担。此时通过合作医疗报销可能涉嫌骗保。
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自身过错或逃逸的特殊情况
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若事故由受害者自身原因导致，或肇事者逃逸且无法追责，经相关部门认定后，可能允许受害者通过合作医疗报销部分费用，但需严格审核证明材料。
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若受害者通过虚报、伪造等手段骗取报销，则属于违法行为，可能面临罚款或刑事责任。
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二、具体情形分析
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责任方已赔偿
若受害者已通过交通事故责任认定获得责任方赔偿，再通过合作医疗报销属于重复获赔，可能违反合作医疗规定。
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用人单位未参保
员工受伤时若用人单位未缴纳工伤保险，员工需自行承担医疗费用，此时通过合作医疗报销可能涉及违法，需通过工伤认定和劳动仲裁程序处理。
三、法律后果
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骗保行为 ：以欺诈手段骗取医保基金，将面临罚款（金额2倍以上5倍以下）或刑事责任。
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重复报销 ：可能被要求退回已获赔偿的医保费用，并承担相应法律责任。
四、建议
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事故责任明确时，优先通过责任方或保险理赔，避免使用合作医疗报销。
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若涉及工伤，需按规定申请工伤认定，不可擅自通过合作医疗报销。
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发现报销异常时，可向医保部门或劳动监察部门投诉举报。