南京市允许灵活就业人员通过个人身份单独缴纳医保。根据南京市医保政策，未在用人单位参加职工医保的灵活就业人员，包括无雇工个体工商户、非全日制从业人员、新业态从业人员等，均可自愿参加职工医保。

灵活就业人员参保条件

1. 参保范围：持有南京市居住证或港澳台居民居住证的灵活就业人员。
2. 参保限制：未参加企业职工基本养老保险的灵活就业人员，可选择单独参加职工医保。

参保渠道

1. 线上办理：通过“南京医保”微信公众号、“我的南京”App或南京市医疗保障局官网，进入网上办事专区完成参保登记。
2. 线下办理：前往税务部门或医保经办机构办理相关手续。

缴费方式

灵活就业人员每月需向税务部门指定的银行账户缴纳医保费用。缴费金额根据南京市医保政策确定，具体金额可咨询医保经办机构。

注意事项

1. 缴费时限：灵活就业人员需按时足额缴纳医保费用，否则可能影响医保待遇。
2. 待遇享受：参保后，可享受南京市职工医保的相关医疗待遇，包括门诊、住院等医疗服务。

总结

通过“我的南京”App等线上渠道，灵活就业人员可以方便快捷地完成医保参保登记和缴费，享受南京市医保的全面保障。如需进一步了解，可咨询南京市医保局或相关经办机构。