海南琼中社保基数5900元的个人扣款金额主要取决于缴费基数和缴费比例。根据海南省社保政策，灵活就业人员的基本养老保险缴费比例为20%，医疗保险缴费比例约为9%至12%。以下是具体计算方法：
1. 养老保险扣款金额
养老保险缴费基数5900元，费率为20%，则个人每月需缴纳的养老保险金额为：
5900元 × 20% = 1180元
2. 医疗保险扣款金额
医疗保险缴费基数5900元，费率为9%至12%，则个人每月需缴纳的医疗保险金额范围为：
5900元 × 9% = 531元
5900元 × 12% = 708元
3. 合计扣款金额
将养老保险和医疗保险的最低与最高缴费金额相加，个人每月需缴纳的社保费用范围为：
最低：1180元 + 531元 = 1711元
最高：1180元 + 708元 = 1888元
4. 影响因素
实际扣款金额可能因政策调整或地区差异而有所不同。例如，琼中县可能存在特殊政策，建议参保人员咨询当地社保部门以获取准确信息。
总结
以5900元为缴费基数，海南琼中灵活就业人员每月社保扣款金额在1711元至1888元之间。为确保缴费准确无误，建议通过官方渠道确认具体政策及缴费比例。