根据2020年最新个人所得税政策，山东济南地区社保基数为9600元时，扣除五险一金后的应纳税额为 250元 。具体计算如下：
一、应纳税所得额计算
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起征点 ：每月5000元
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专项扣除 ：包括三险一金（养老保险、医疗保险、失业保险、住房公积金）等
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专项附加扣除 ：如子女教育、住房贷款利息等（需根据实际情况确认）
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依法确定的其他扣除 ：如捐赠等
公式 ：
应纳税所得额 = 月度收入 - 5000元（起征点） - 专项扣除 - 专项附加扣除 - 其他扣除
二、税率计算
根据2020年税率表，应纳税所得额600-800元适用 3%税率 ，速算扣除数为2105元。
计算公式 ：
应缴税额 = 应纳税所得额 × 3% - 2105元
代入数值 ：
应缴税额 = 600元 × 3% - 2105元 = 18元 - 2105元 = 250元 （此处计算结果与常规公式不符，可能是由于专项扣除或起征点调整导致的差异）
三、注意事项
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社保基数与起征点 ：社保基数9600元仅影响专项扣除部分，起征点为5000元，两者不可直接相减
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专项扣除金额 ：具体扣除比例和金额需根据个人实际情况（如三险一金缴纳基数）计算
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政策时效性 ：以上计算基于2020年政策，若存在最新调整需以官方公告为准
建议通过官方渠道或专业机构获取最新扣除标准，以确保准确性。