很抱歉，目前搜索结果中并未提及“江西赣州社保基数5000和5000”的具体区别。根据现有信息，社保基数5000元在不同场景下存在以下差异：
一、缴费比例差异
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单位缴费
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若以5000元为缴费基数，单位需缴纳16%（养老保险）+8%（医疗保险）=24%；
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若以5000元为缴费基数且按300%缴费比例，则单位实际缴费基数为15000元，总缴费比例为24%。
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个人缴费
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无论单位缴费比例如何，个人均按8%比例缴纳养老保险，医疗保险按2%缴纳；
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若单位按300%缴费比例，个人实际缴费基数为3000元，个人账户金额为3000×8%=240元。
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二、缴费档次差异
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5000元通常属于当地职工平均工资的80%-100%档位，具体分档需参考赣州当地政策。例如：
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若当地平均工资为6000元，5000元为80%档位；
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若平均工资为7000元，5000元为71.4%档位。
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三、待遇差异
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养老金计算
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基础养老金=（全省上年度在岗职工月平均工资+本人指数化月平均缴费工资）/2×缴费年限×1%；
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个人账户养老金=个人账户累计储存额/计发月数；
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缴费基数越高，计发基数和基础养老金比例越高，退休后每月领取的养老金总额也越高。
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医疗保险待遇
- 医疗报销比例与缴费基数相关，基数越高，个人账户累计额越高，门诊、住院等报销额度也越高。
四、其他差异
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灵活就业人员对比 ：若以5000元为缴费基数，灵活就业人员需缴纳20%（含12%统筹+8%个人账户），而职工仅需缴纳16%+8%；
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缴费范围 ：企业缴纳社保包含五险，个人缴纳仅含养老和医疗。
总结
若问题中“5000和5000”存在差异，可能是指不同缴费比例或缴费档次。建议结合赣州当地政策确认具体差异，并关注社保缴费基数调整通知。