江西萍乡社保基数16400元和5000元的区别主要体现在以下方面：
缴费金额
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养老保险：
- 缴费基数为16400元时，单位缴费金额为16400×16%=2624元，个人缴费金额为16400×8%=1312元。
- 缴费基数为5000元时，单位缴费金额为5000×16%=800元，个人缴费金额为5000×8%=400元。
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医疗保险：
- 缴费基数为16400元时，单位缴费金额约为16400×8%=1312元，个人缴费金额为16400×2%=328元。
- 缴费基数为5000元时，单位缴费金额约为5000×8%=400元，个人缴费金额为5000×2%=100元。
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失业保险：
- 缴费基数为16400元时，单位缴费金额为16400×0.5%=82元，个人缴费金额为16400×0.5%=82元。
- 缴费基数为5000元时，单位缴费金额为5000×0.5%=25元，个人缴费金额为5000×0.5%=25元。
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工伤保险：
- 缴费基数为16400元时，单位缴费金额根据行业风险等级确定，假设为1%，则单位应缴纳16400×1%=164元。
- 缴费基数为5000元时，单位缴费金额同样根据行业风险等级确定，假设为1%，则单位应缴纳5000×1%=50元。
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生育保险：
- 缴费基数为16400元时，单位缴费金额为16400×0.7%=114.8元。
- 缴费基数为5000元时，生育保险已并入医疗保险，不再单独计算。
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总缴费金额：
- 缴费基数为16400元时，总缴费金额约为2624+1312+1312+82+114.8=5444.8元。
- 缴费基数为5000元时，总缴费金额约为800+400+25+25+100=1550元。