医保门诊和住院的门槛费是分开管理的，具体区别如下：
一、定义与支付方式
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门诊门槛费
指医保参保人在门诊就诊时需先自行支付的一定费用，超过该金额后医保开始报销。例如，某地门诊报销门槛费为350元，超过部分按比例报销。
- 支付时间 ：每次门诊就诊时支付。
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住院门槛费
指医保参保人住院时需先支付的一定费用，超过该金额后医保开始报销。例如，某地住院门槛费标准为：社区卫生服务中心100元、一级医院200元、二级医院300元、三级医院400元。
- 支付时间 ：出院结算时一次性支付。
二、费用范围与报销规则
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门诊门槛费
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仅限门诊目录内费用，不包含乙类先行自付、目录外及个人自费部分。
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部分地区对慢性病患者有特殊政策，如上海、北京等城市职工医保门诊报销门槛费为1800元，超过后按50%比例报销。
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住院门槛费
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仅限住院目录内费用，同样不包含乙类先行自付、目录外及个人自费部分。
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不同医院等级对应不同门槛费标准。
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三、累计计算与政策差异
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门诊门槛费 按自然年度累计计算，全年多次就诊费用累加。
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住院门槛费 通常以一次住院为限，仅限单次住院事件。
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具体金额标准因地区和医保类型不同而有所差异，例如大连职工医保门诊起付标准为1800元。
四、法律依据与调整机制
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门槛费作为医保基金收支平衡的调控手段，由医保部门根据地区经济水平和医疗成本制定。
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部分城市通过“门诊共济”改革调整门槛费标准，例如降低门诊起付线以扩大报销范围。
医保门诊和住院的门槛费在定义、支付方式、费用范围及政策机制上均存在明显差异，需根据当地医保政策具体执行。