山西太原社保基数12600和5000在缴费金额、养老金待遇、医保报销及失业金领取等方面存在显著差异。具体如下：
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缴费金额：社保基数越高，个人和单位缴纳的社保费用就越多。按照太原市的社保缴费比例，养老保险个人缴纳8%，医疗保险个人缴纳2%（另加大病统筹），失业保险个人缴纳1%，工伤保险和生育保险个人不缴纳。若社保基数为12600元，个人每月需缴纳社保费用为12600×(8%+2%+1%)=1419元；而社保基数为5000元时，个人每月缴纳的社保费用为5000×(8%+2%+1%)=550元。社保基数12600元时个人缴纳的社保费用比5000元时多。
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养老金待遇：养老金的计算与缴费基数、缴费年限等因素有关。在其他条件相同的情况下，社保基数越高，退休后领取的养老金就越多。因为养老金的计算通常与个人缴费基数和缴费年限挂钩，缴费基数高意味着个人账户积累的养老金多，从而退休后领取的养老金也相应增加。
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医保报销：虽然医保报销比例与社保基数无直接关联，但社保基数高可能意味着更高的医疗保障水平。一些地方的医保政策可能规定，连续缴纳社保达到一定年限且缴费基数达到一定水平的人，可以享受更高的医保报销比例或更广泛的医保待遇。
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失业金领取：失业金的领取通常与个人的缴费基数和缴费年限有关。社保基数高的人在失业时可能领取到相对较高的失业金，因为失业金的计算往往与个人缴费基数和缴费年限挂钩。
社保基数12600元相比5000元在缴费金额上更高，但相应地也会带来更高的养老金待遇、医疗保障水平和失业金领取标准。选择哪个社保基数需要根据个人的经济状况和未来规划来决定。