农村合作医疗报销门槛主要分为起付线、报销比例和封顶线三个部分，具体标准如下：

一、起付线标准

1. 不同医疗机构级别差异

   • 村卫生室/乡镇卫生院 ：门诊起付线为300元，住院起付线为100元

   • 县级定点医疗机构 ：门诊起付线为500元，住院起付线为350元

   • 二级医院 ：门诊起付线为500元，住院起付线为500元

   • 三级医院 ：门诊无起付线，住院起付线为700元

2. 特殊群体优惠

   • 60周岁以上老年人在乡镇卫生院住院，每日补偿10元，限额200元

二、报销比例

1. 门诊报销比例

   • 村卫生室/乡镇卫生院 ：按25%报销，门诊补偿总额每年最高150元

   • 县级及以上医院 ：门诊费用不予报销

2. 住院报销比例

   • 村卫生室/乡镇卫生院 ：85%报销比例（300元起付线）

   • 县级医院 ：70%报销比例（500元起付线）

   • 二级医院 ：55%报销比例（5000元起付线）

   • 三级医院 ：50%报销比例（1000元起付线）

三、封顶线与特殊政策

1. 住院补偿封顶线

   • 一般地区为2万元，部分地区可能更高

   • 2025年最新政策中，封顶线仍为2万元

2. 门诊大病补偿

   • 门诊慢性病（如肿瘤、尿毒症等）可申请门诊大病统筹，累计医疗费用超过5000元时开始补偿

   • 补偿比例一般为60%-80%，封顶线1.1万元

四、其他注意事项

• 报销流程 ：需提供合作医疗证、医疗费用单据、病历等材料，次年1月前结算

• 药品费用限制 ：处方药费每贴不超过1元，检查费、手术费有专项限额

• 异地就医 ：可通过异地就医结算制度报销，具体比例可能不同

以上标准综合了2020-2025年最新政策，具体以当地医保部门规定为准。