医保公司缴费部分不能用，主要是因为这部分资金进入社会统筹基金，用于全体参保人员医疗费用支付，而非特定个人的直接使用。以下是具体原因：
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资金来源与性质不同：公司缴纳的医保费用属于统筹基金，是众多参保人员共同缴费形成的基金池，主要用于支付全体参保人员的住院医疗及部分门诊大病费用等，具有共济保障的性质。而个人账户的资金则是由个人缴费的一部分积累形成，归个人所有，主要用于支付门诊费用、住院费用中的个人自付部分及定点药店购药费用等。
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保障范围与用途差异：统筹基金的保障范围更广，侧重于保障参保人员的重大疾病和住院治疗等高额医疗费用支出，以减轻患者的经济负担，防止因病致贫、因病返贫。个人账户则主要用于支付一些日常的、小额的医疗费用，方便参保人员在门诊就医和购药时使用。
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政策规定与管理要求：根据国家相关医保政策规定，明确了公司缴纳部分和个人缴纳部分的不同用途和管理方式。统筹基金由医保经办机构统一管理，按照规定的比例和范围进行支付，以确保基金的合理使用和可持续性。个人账户则由参保人员自行管理和使用，但也需要遵守医保政策的相关规定。
总的来说，医保公司缴费部分作为统筹基金，旨在为全体参保人员提供更广泛的医疗保障，特别是针对重大疾病和住院治疗等高额费用。这部分资金并不能直接用于个人的特定医疗费用支出，而是需要通过医保经办机构的统筹安排，确保资金的合理分配和使用。