更换单位后医保余额不会清零，具体说明如下：
一、医保账户余额的属性
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个人账户资金性质
医保个人账户资金属于参保人个人权益，具有终身积累性，未使用的余额不会因单位变动而清零。
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账户余额的转移规则
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职工医保个人账户资金可随参保关系转移，包括跨省转移；
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更换单位时，原单位个人账户余额会自动转入新单位医保卡的个人账户。
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二、更换单位后医保账户的处理方式
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正常转移情况
若新单位已依法缴纳医保，原单位个人账户余额将无缝转入新单位账户，可正常使用。
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医保断缴风险
若新单位未及时缴纳医保，可能导致医保断缴超过3个月，此时需按灵活就业人员方式续缴。断缴期间医保卡将暂停使用，但账户余额不会清零。
三、特殊情况说明
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重复账户问题 ：若发现名下存在多个医保账户，需联系医保部门核实，避免因账户混淆影响待遇；
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退休后的处理 ：退休后医保个人账户余额可继续使用，无需再缴纳保险费。
四、注意事项
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医保卡余额仅限支付医疗费用，不可取现；
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异地就医需提前备案，部分地区对异地医疗费用报销有额外规定。
更换单位不会导致医保余额清零，但需注意医保缴费状态和账户转移流程。若遇到账户异常，建议通过医保局或单位人力资源部门咨询处理。