昭通市农村合作医疗报销比例根据医疗机构等级和医疗费用类型有所不同，具体如下：

一、门诊报销比例

1. 村级卫生室/乡卫生院

   报销比例60%

   门诊补偿限额每人每年最高150元。

2. 镇级卫生院

   报销比例40%

   门诊补偿限额5000元/年。

3. 二级及以上医院

   • 普通门诊 ：30%-50%

   • 住院费用 ：60%-80%。

二、住院报销比例

1. 乡卫生院

   报销比例60%

   起付线100元，封顶线40000元。

2. 二级医院

   报销比例40%

   起付线500元，分段补偿：

   • 5000元以下50%

   • 5000-10000元55%

   • 10000元以上60%。

3. 三级医院

   报销比例30%

   起付线700元，分段补偿：

   • 5000元以下35%

   • 5000-10000元40%

   • 10000元以上45%。

三、大病保险补充

• 起付线 ：5000元

• 补偿比例 ：

  • 5001-10000元65%

  • 10001-1.8万元70%

  • 1.8万元以上80%

• 特殊病种 ：如儿童先心病、肺癌等8种大病，报销比例可达70%。

四、其他注意事项

1. 报销限额 ：门诊统筹年度最高报销150元，住院封顶线40000元。

2. 起付线差异 ：部分政策对一级医院（如镇卫生院）设100元起付线，三级医院不设起付线。

3. 药品/检查报销 ：部分检查项目（如CT、核磁共振）和处方药有200元/年限额。

建议参保人员就诊前咨询当地医保部门，具体比例可能因政策调整而变化。