法律强制参保，协商或解雇
关于企业员工已参加新型农村合作医疗（农保）但不愿参加职工社保的问题，处理方式需结合法律规定和实际情况综合判断，具体可分为以下情形：
一、企业依法必须参保的情形
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法律强制要求
根据《社会保险法》第五十八条规定，用人单位必须为用工之日起30日内为职工办理社会保险登记并缴费，且不得以员工个人意愿拒绝参保。若员工拒绝参保，企业仍需依法履行缴费义务。
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特殊情况处理
- 若员工在老家已参加农保，可提供缴费清单申请在其户籍地参保，企业无需重复缴费。
二、协商与录用条件
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录用时明确要求
企业可在录用合同中规定“不愿意缴纳社会保险”作为试用期录用条件。但需注意，试用期解除合同需符合《劳动合同法》的规定，且试用期本身不包含在试用期内。
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沟通与协商
通过沟通了解员工顾虑（如工资扣除问题），可提供社保待遇计算示例（如养老、医疗等长期利益），劝说其参保。
三、法律后果与风险
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企业责任
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若超过30天未参保，社保机构将核定应缴金额，企业需补缴。
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员工可因企业未缴社保主张经济补偿金，并可向劳动仲裁或社保机构投诉。
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员工风险
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企业若因未缴社保发生工伤，需承担全部医疗费用，且无法通过社保报销。
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即使员工主动放弃社保，企业仍需依法参保，否则可能面临法律诉讼。
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四、建议处理步骤
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核查参保状态
确认员工农保缴费情况，避免重复参保或漏缴。
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依法参保
按规定办理职工社保登记并缴费，避免因违规操作引发法律风险。
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完善录用条款
在招聘时明确社保缴纳义务，减少后续纠纷。
总结
企业必须依法为员工缴纳社保，无法因员工已参加农保而免除责任。建议通过沟通协商解决员工顾虑，同时完善用工管理流程，降低合规风险。若员工坚持拒绝参保，企业可依法解除劳动合同，但需承担相应法律责任。