新农合县医院报销比例根据医疗机构级别和地区政策有所不同，具体如下：
一、住院报销比例
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一级医疗机构（乡镇卫生院）
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起付线400元以下不设起付线，报销比例达75%-80%；
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超出部分按比例报销，例如1000元起付线后报销65%-80%。
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二级医疗机构
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起付线400-6000元，报销比例75%-80%；
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6000元以上部分按比例报销，例如6000元起付线后报销65%-80%。
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三级医疗机构
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起付线600-1.2万元，报销比例55%-60%；
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超出部分按比例报销，例如1.2万元起付线后报销65%-80%。
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二、门诊报销比例
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村卫生室/社区卫生服务站
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报销比例60%-70%；
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部分地区可达80%。
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乡镇卫生院
- 报销比例40%。
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县级医院
- 报销比例30%。
三、其他注意事项
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起付线标准 ：不同地区对起付线金额有差异，例如紫阳县县级医院起付线300元，武汉县二级医院起付线400元。
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大病报销 ：超过5000元部分分段补偿，5001-10000元补偿65%，10001-18000元补偿70%；
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特殊群体 ：60岁以上老人、孕产妇等可享受额外报销或补助。
四、建议
具体报销比例需以参保地最新政策为准，建议就诊前咨询当地医保部门或医院医保办，了解当地对药品、检查项目的报销范围及限额。