小儿肠吸收不良综合征如果不治疗，可能会导致以下严重后果：
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营养缺乏
- 蛋白质缺乏：长期蛋白质吸收不良会使儿童体重减轻、消瘦，严重时会出现营养不良性水肿，甚至恶病质。还会导致血浆蛋白降低，出现低蛋白血症，影响儿童身体正常的生理功能和生长发育。
- 糖类缺乏：糖吸收不良的患儿进食乳类食品后会出现渗透性腹泻，为水样便，粪脂不增加，粪便酸臭，有泡沫，常有腹部不适、腹胀、排气增多的表现，严重者出现水、电解质和酸碱平衡紊乱。
- 脂肪吸收不良：脂肪泻患者可出现骨质疏松或病理性骨折；长期维生素D、钙、镁缺乏引起的手足搐搦症；脂肪吸收不良所致的脂溶性维生素K吸收不良和低凝血酶原血症而引起的出血倾向。
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生长发育障碍
- 生长迟缓：由于营养物质无法被有效吸收和利用，机体缺乏必要的营养支持，儿童的身体生长速度会明显减慢，身高、体重等生长指标可能落后于同龄人。长期的生长发育迟缓可能会影响儿童的骨骼发育、智力发育等，对其成年后的身体健康和生活质量也会产生负面影响。
- 器官功能发育不全：例如，维生素A缺乏会影响视力发育，导致夜盲症等视觉问题；维生素D缺乏会影响钙的吸收和骨骼发育，易导致佝偻病等。
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免疫力下降
- 营养物质缺乏会导致免疫系统功能受到影响，免疫球蛋白合成减少，使儿童更容易受到细菌、病毒等病原体的感染，且感染后恢复时间可能会延长，容易发生反复感染，如呼吸道感染、胃肠道感染等。
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代谢紊乱
- 水、电解质及酸碱平衡紊乱：小肠吸收不良综合征会引起水和电解质紊乱。例如，钾离子补充不足可加重无力、软弱、生理性少尿、夜尿增多等。
- 血糖异常：糖吸收不良可能导致血糖波动，严重时可能出现低血糖症状，如头晕、出汗、心慌、乏力等，影响儿童的正常活动和学习。
小儿肠吸收不良综合征若不及时治疗，会对儿童的营养状况、生长发育、免疫功能等方面产生严重的不良影响。家长应重视孩子的健康，一旦发现相关症状，应及时带孩子就医，明确诊断并采取相应的治疗措施，以避免不良后果的发生。