卡尔曼综合征的危害较大，主要体现在以下几个方面：
- 生殖系统方面
- 性腺发育障碍：男性患者会出现睾丸体积小、阴茎短小、无阴毛生长、小睾丸或隐睾等症状，女性患者则表现为乳腺不发育、幼稚外阴和原发闭经等，导致患者无法正常进行生育，失去自然受孕的能力。
- 性功能异常：男性可能出现性欲减退、勃起功能障碍，女性会有性欲低下、阴道干涩等问题，这会对患者的性生活质量产生严重影响，进而影响到患者的婚姻和家庭生活。
- 嗅觉系统方面：患者存在嗅觉减退或缺失的问题，难以辨别各种气味，这不仅会影响生活体验，例如无法享受食物的香味，还可能带来安全隐患，如不能察觉煤气泄漏、火灾烟雾等危险气味。
- 身体发育方面
- 身材异常：由于青春期缺乏足够的性激素刺激，骨骼生长板闭合延迟，患者往往四肢过长，身材瘦高，上下身比例失调，下身长度明显大于上身，影响身体美观，还可能导致身体重心不稳，增加摔倒受伤的风险。
- 面部及口腔异常：部分患者会出现鞍鼻、牙齿发育异常、腭弓高尖等问题，不仅影响面部美观，还可能对口腔功能产生影响，如咀嚼、发音等。
- 骨骼健康问题：长期的性腺功能减退会影响骨密度，使患者易患骨质疏松症，增加骨折的风险，影响骨骼的正常结构和功能。
- 心理健康方面：因身体发育与同龄人不同，如第二性征不发育、身材异常等，患者容易产生自卑、焦虑、抑郁等心理问题，影响其社交能力和心理健康，严重时可能导致性格孤僻，甚至出现心理障碍，对生活质量和个人发展造成负面影响。
虽然卡尔曼综合征危害较大，但通过早期诊断和适当的治疗，如激素替代治疗等，可以在一定程度上减轻这些危害，提高患者的生活质量。