南方医科大学旗下共有七家医院。

这七家医院分别是：

1. 南方医科大学南方医院：创建于1941年，是南方医科大学的第一附属医院和第一临床医学院，集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大规模综合性三级甲等医院。
2. 南方医科大学珠江医院：位于广东省广州市，前身为中国人民解放军第一八四医院，现为南方医科大学的第二附属医院和第二临床医学院。
3. 南方医科大学第三附属医院：原名广东省邮电医院，后更名为南方医科大学第三附属医院，是一所集医疗、教学、科研和健康管理为一体的三级甲等综合性医院。
4. 南方医科大学中西医结合医院：作为南方医科大学的第四附属医院，它是一所以西医为基础，中医为特色的中西医结合医院，拥有肿瘤学科等多个优势学科。
5. 南方医科大学第五附属医院：这是一家集医疗、教学、科研、急救、预防、保健等功能于一体的综合性三级甲等医院。
6. 南方医科大学深圳医院：由深圳市政府投资兴建，委托南方医科大学全面管理，成为其直属附属医院和第四临床医学院。
7. 南方医科大学口腔医院：前身为广东省口腔医院，现在是南方医科大学管理下的口腔医院，同时保留了广东省口腔医院的名称。

这些医院均隶属于南方医科大学，共同构成了该大学的医疗体系，为社会提供了广泛的医疗服务，并支持学校的教学和科研活动。