四川土司的分布主要集中在以下地区：
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乌蒙、乌撒、东川、镇雄 ：这些地区在明代属于四川布政司的管辖范围，设有军民府等行政机构。
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马湖、建昌卫、宁番卫、越巂卫、盐井卫、会川卫、茂州卫、松潘卫、天全六番招讨司、黎州安抚司 ：这些地区和机构也是四川土司制度的一部分。
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嘉绒地区 ：包括明正土司、冷边土司、沈边土司、鱼通土司、穆坪土司、丹东土司、巴底土司、巴旺土司、绰斯甲土司、促浸土司、攒拉土司、鄂克什土司等，这些土司势力主要集中在川西地区。
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平武 ：平武土司制度自南宋末年开始，由王行俭进入龙州任判官而始，延续了长达七百余年，平武土司家族在这片土地上留下了丰富的文化遗产。
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凉山地区 ：凉山地区以彝族为主体，元王朝开始全面推行土司制度直至清亡，岭氏土司居凉山四大土司之首。
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阿坝藏族地区 ：阿坝藏族地区的土司一般无专设武装机构和常备兵员，但在清末引入新式武器后，一些部落按家庭贫富分为五个等级。
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其他边疆地区 ：如播州、永宁、酉阳、石硅等地也设有土司政权。
这些土司政权在明代四川地区的政治、军事和文化生活中扮演了重要角色，其分布和影响力反映了当时四川地区的复杂地理环境和多民族共存的现实。