根据南京市社保政策及《中华人民共和国社会保险法》相关规定，社保停缴后是否可以只缴纳医保需分情况讨论：
一、单位参保情况
- 企业职工
若单位停止缴纳社保，需补缴所有五险（养老、医疗、失业、工伤、生育保险）才能恢复待遇。若单位未依法缴纳，个人无法单独补缴。
- 灵活就业人员
可以以个人身份选择缴纳 居民医疗保险 或 养老保险 ，但需注意：
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养老保险需累计缴费满15年才能领取养老金；
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医疗保险断缴超过3个月将停止享受门诊等医保待遇，需连续参保满6个月才能恢复。
二、个人参保情况
- 居民医疗保险
可单独缴纳，但断缴期间无法享受门诊、住院等医保待遇，仅能使用个人账户余额支付药品和门诊费用。
- 养老保险
需累计缴费满15年，断缴期间不享受养老金待遇。
三、其他注意事项
- 生育保险与医疗保险
若涉及生育相关医疗费用，需连续参保，断缴期间无法享受生育医疗报销。
- 影响其他权益
社保断缴可能影响医疗费用报销、养老金领取等长期权益，建议尽量保持参保状态。
四、操作建议
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单位参保 ：与单位协商补缴或转至灵活就业人员参保；
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个人参保 ：通过当地社保机构办理居民医保或养老保险参保手续。
综上，南京2024年社保暂停后仅缴纳医保需符合个人参保条件且不影响其他权益，但医疗保险断缴会直接影响医疗保障。建议根据实际情况选择合规参保方式。