石河子空气质量较差的原因主要有以下几点：
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工业排放 ：石河子市燃煤锅炉数量增加和工业园规模不断扩大，导致二氧化硫排放量上升，尤其是电力（火电）行业污染尤为严重。这些工业活动产生了大量的污染物，对空气质量造成了显著影响。
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地理位置和气候条件 ：石河子市位于天山北坡地带，冬季长时间受静稳天气条件控制，污染物扩散条件较差，容易出现大气重污染过程。此外，北方冷空气活动少且偏北，南方暖湿空气也不活跃，导致本地区较长时间内大气处于稳定状态，不利于雾霾扩散。
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工业布局集中 ：石河子市工业布局较为集中，单位面积污染排放总量较大，导致污染物在局部区域内浓度较高。
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气象因素 ：冬季冷空气下沉厉害，污染物不容易扩散，整个环北疆地区的大气循环都较差，这对石河子的空气质量也产生了不利影响。
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环保措施不足 ：虽然石河子市环保部门采取了多项措施，但仍有部分企业存在高污染、高耗能的问题，且环保部门在应对空气污染方面的效果有限。
综上所述，石河子空气质量较差的原因是多方面的，包括工业排放、地理位置和气候条件、工业布局集中、气象因素以及环保措施不足等。要改善石河子的空气质量，需要从多个方面入手，综合施策。