深户和非深户少儿医保的主要区别体现在以下几个方面：
- 参保条件 ：
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深户少儿 ：无论是否在园在校都可以参加少儿医保。
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非深户少儿 ：需满足以下条件之一方可参保：
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为深圳市中小学在册学生，且父母一方正在参加深圳市社会保险满1年以上；
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为深圳市托幼机构在册学生，且父母一方正在参加深圳市社会保险满1年以上；
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在深圳市各类全日制普通高等学校（含民办学校）接受普通高等学历教育的全日制学生；
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在深圳市科研院所中接受普通高等学历教育的全日制学生。
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缴费方式 ：
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深户少儿 ：
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在园在校：费用交到学校；
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非在园在校：进行参保登记后，在预留的银行卡账户中直接划扣；或者自己缴费。
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非深户少儿 ：只能由所在学校统一参保和缴费。
- 医保待遇 ：
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深户少儿 ：
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普通门诊：在本市选定社康中心的门诊费用，药品目录内的甲类药报销80%，乙类药报销60%；医保目录内单项诊疗或医用材料的，报销90%，最高报销不超过120元；在一个医保年度内最高报销总额不超过1000元。
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门诊大病：根据连续参保时间确定待遇支付标准。连续参保12个月以下，报销60%；连续参保12—35个月，报销75%；连续参保36个月及以上，报销90%。
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住院待遇：一级以下医院起付线100元，二级医院起付线200元，三级医院起付线300元；目录内特材/人工器官/单价千元以上一次性医用材料，国产材料报销90%、进口材料报销60%；床位费最高报销60元/日；医保目录内扣减上述剩余费用报销90%。
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非深户少儿 ：
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3岁以下无法办理少儿医保，需等待入园后，且父母任一方在深圳参加社保并满一年以上才可参保。
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住院医疗险即可，门诊只有在绑定医保的医院可用报销，且额度有限。
- 其他福利 ：
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深户少儿 ：从出生一刻起就享受少儿医保，包括免费疫苗等。
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非深户少儿 ：需满足一定条件才能参保，且无法享受与深户相同的门诊报销等福利。
综上所述，深户和非深户少儿医保在参保条件、缴费方式及医保待遇上均有明显差异。深户少儿医保待遇较为全面，从出生起就能享受相关福利，而非深户少儿医保则需满足更多条件，且待遇相对有限。建议家长根据自身情况选择适合的参保方式，确保孩子能够享受到应有的医疗保障。