灵活就业医保卡里没有钱的原因主要有以下几点：

1. 选择低缴费档次 ：灵活就业人员在缴纳医保时，可以选择不同的档次，低档次缴费通常没有医保个人账户，因此不会有钱划入医保卡。

2. 未及时补缴保险费用 ：如果灵活就业人员未能在规定的时间内及时补缴医保费用，会导致医保卡内没有资金。

3. 信息不一致或无法识别 ：个人信息与医保系统中的信息不一致，或者由于户籍变更、档案迁移等原因导致医保卡无法识别个人身份和缴费情况，也会导致医保卡内没有资金。

4. 职工医保未生效 ：有些地方的医保政策规定，灵活就业人员需要等待六个月后才能享受医保待遇，这期间个人账户也不会有钱。

5. 缴费基数和比例问题 ：灵活就业人员的缴费基数和比例也会影响医保卡内的资金。例如，按最低档次缴纳时，所有资金都进入统筹基金，不会设立个人账户。

6. 系统更新延迟 ：有时候医保卡内没有资金可能是因为系统更新延迟，过几天再查就好。

7. 医保结算流程问题 ：一些地区或医疗机构在医保结算过程中存在各种问题，如医保卡的刷卡机器故障、医保结算系统漏洞等，也可能导致医保卡内没有资金。

综上所述，灵活就业医保卡里没有钱的原因多种多样，建议灵活就业人员及时了解当地医保政策，按时足额缴纳医保费用，并定期查询医保卡余额，以确保能够正常享受医保待遇。