农村合并被叫停的原因主要有以下几点：
- 利益冲突 ：
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农民利益受损 ：农村合并往往涉及到土地调整、人口迁移和产业整合，这些都需要巨大的资金和时间投入。农民担心土地被收回、房屋被拆迁，从而面临生活困境。此外，农民对新环境的不熟悉，生活反而变得更不方便。
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补偿问题 ：农村合并的补偿标准往往较低，与城市的补偿相比，农民获得的补偿不足以弥补损失，导致农民对合并产生抵触情绪。
- 资金与资源不足 ：
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财政压力 ：地方政府财政压力较大，难以承担合并所需的巨大开支。
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资源分配不均 ：合并后资源分配可能不均，导致一些村庄资源反而变得更紧缺。
- 农民意愿与政策目标的冲突 ：
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政策目标不一致 ：政府希望通过合并推动农业现代化，提高农村经济发展水平，而农民更关注自己的切身利益，如土地权益、住房条件等。
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农民参与度低 ：农民对合并的积极性不高，部分农民甚至不愿意参与，导致合并推进困难。
- 管理挑战 ：
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管理难度增加 ：合并后的村庄规模扩大，人口增多，对管理提出了新的挑战，原有的管理模式难以适应新的需求。
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经济与社会问题 ：合并后的村庄需要面对更复杂的经济、社会等问题，如产业发展、基础设施建设、公共服务等，这些都需要政府投入更多的精力和资源来解决。
- 文化与传统损失 ：
- 文化破坏 ：农村合并可能导致一些传统建筑、祠堂、祖坟等被拆除，对农民的文化认同造成严重影响。
综上所述，农村合并被叫停是由于多方面因素共同作用的结果，包括利益冲突、资金与资源不足、农民意愿与政策目标的冲突、管理挑战以及文化与传统的损失。这些因素使得农村合并的推进变得异常艰难，最终导致政策被暂停或调整。