北京同仁医院的亦庄院区（南区）和东区各有其特点，哪个更好取决于您的具体需求：

科室设置

• 东区：主要设有眼科、耳鼻喉科特需门诊、整形美容中心、眼屈光中心、白内障中心、儿童斜弱视、足踝外科、体检中心等特色科室。

• 亦庄院区：是一个综合性的院区，设有儿科、妇产科等特色科室，同时眼科也是其重点专科之一。

医疗资源

• 东区：作为医院的老院区之一，医疗资源丰富，专家团队强大，尤其在眼科和耳鼻喉科领域有着深厚的底蕴和丰富的临床经验。

• 亦庄院区：虽然发展时间相对较短，但依托医院的整体优势，医疗资源也在不断充实和完善，设备设施较为先进。

就医环境

• 东区：位于北京市东城区崇文门内大街，地理位置优越，交通便利，周边配套设施完善。医院内部环境较好，但相对较为紧凑。

• 亦庄院区：位于北京经济技术开发区，环境较为安静，医院设施新，空间宽敞，为患者提供了较为舒适的就医环境。

交通便利性

• 东区：地处市中心，交通非常便利，有多条公交线路和地铁线路经过，方便患者前来就医。

• 亦庄院区：虽然相对远离市中心，但随着城市的发展，交通也在不断改善，可以通过地铁亦庄线到达，对于居住在亦庄及周边地区的患者来说较为方便。

总结

• 如果您需要就诊的科室在东区有特色门诊或专家，且您对就医环境和交通便利性有较高要求，那么东区可能更适合您。

• 如果您更看重综合性的医疗服务，尤其是儿科、妇产科等科室，或者您居住在亦庄附近，那么亦庄院区可能更适合您。