在甘肃嘉峪关，社保基数设定为16800元和5000元的主要区别在于缴费金额和个人账户积累的速度。高基数意味着更高的缴费额，这将直接导致个人养老保险账户中积累的资金更多，未来可能领取的养老金也会相应增加。这也影响到医疗保险、失业保险等其他社会保险的缴纳金额。

• 缴费金额差异：当社保基数为16800元时，按照现行的养老保险个人8%的缴费比例计算，每月个人需缴纳的养老保险费为1344元；而若基数为5000元，则每月只需缴纳400元。这意味着选择较高的基数，短期内会增加个人的经济负担。

• 退休后收益对比：由于养老保险遵循“多缴多得”的原则，较高的社保基数将在长期内转化为更丰厚的养老金待遇。以16800元基数缴纳的职工，在满足退休条件后，理论上可获得比5000元基数缴纳者更多的养老金收入。

• 短期与长期考虑：对于年轻且收入稳定的职工来说，选择较高的社保基数可以视为一种长期投资，有助于保障退休生活的质量。而对于收入较低或接近退休年龄的人群而言，可能会倾向于选择较低的基数来减轻当前的经济压力。

选择不同的社保基数取决于个人的财务状况、职业规划及对未来的预期。较高的社保基数虽然增加了当前的支出，但长远来看能够带来更好的社会保障和养老保障。反之，选择较低的基数则可以在不影响基本保障的前提下，缓解当前的经济负担。在做决定时应综合考虑个人实际情况。